为了加强集团成员之间的紧密合作，进一步完善校企合作、工学结合的良性机制，寻找集团成员合作利益共同点，推进集团建设，集团秘书处设置专业委员会。各专业委员会设主任1名，副主任2-4名，由职业院校教学部门和企业人力资源部门负责人、技术开发负责人组成。
各专业委员会是在集团理事会的领导下开展工作，主要职责是：
（1）制定现代农业人才培养规划和专业建设规划；
（2）统筹协调农业企业人才需求和职业院校就业工作；
（3）开展农业人才培训与职业资格鉴定；
（4）负责校企合作中实训基地建设、顶岗实习等项目的实施；
（5）联合集团成员开展项目研发、技术推广、技术标准和产品标准研究与制（修）订工作；
（6）对可操作性项目开展专项调研工作，为政府及有关部门提供对策和建议。
（7）积极宣传集团成员，提高集团知名度，发展新成员。